Gen relacionado con COVID prolongado encontrado en análisis de miles de pacientes
Martes 11 de
Julio 2023
La primera búsqueda en todo el genoma de factores de riesgo de COVID prolongado podría allanar el camino para estudios más amplios.
La primera búsqueda de todo el genoma para encontrar factores de riesgo genéticos para un COVID prolongado ha dado un resultado: una secuencia de ADN cerca de un gen llamado FOXP4 , que está activo en los pulmones y en algunas células inmunitarias.
El estudio, que se publicó como preimpresión el 1 de julio , utilizó datos recopilados de 6450 personas con COVID prolongado en 16 países. Los investigadores esperan que este análisis sea solo el comienzo: se requiere una gran cantidad de datos para descubrir un trastorno tan complejo como el COVID, que se ha asociado con más de 200 síntomas, que incluyen fatiga severa, dolor nervioso y dificultades con la concentración y la memoria. .
“Es muy importante que se realice este tipo de estudio”, dice Chris Ponting, quien estudia bioinformática médica en la Universidad de Edimburgo, Reino Unido. “Ganará impulso y mayor poder a medida que aumente el número de casos”.
Dichos estudios son los primeros pasos para aprender más sobre las causas de la COVID prolongada, dice Stéphanie Longet, inmunóloga de la Universidad Jean Monnet en Saint-Étienne, Francia, que tiene COVID prolongada. “Hay varios temas clave que son esenciales para los pacientes, incluidos los tratamientos y la prevención”, dice. “Cuando las causas, tal vez multifactoriales, [se] entiendan claramente, ayudará a tratar a los pacientes que serán más susceptibles a desarrollar una COVID prolongada y potencialmente a prevenir una COVID prolongada”.
genes de susceptibilidad
Durante más de tres años, la Iniciativa de Genética del Huésped COVID-19 global ha estado buscando secuencias de ADN que estén asociadas con un riesgo de desarrollar COVID-19 grave. Esa caza, que está en curso, ha implicado genes involucrados en el sistema inmunológico y en permitir que el virus SARS-CoV-2 ingrese a las células 2 .
El largo estudio COVID es un derivado de ese esfuerzo, dice Hugo Zeberg, genetista del Instituto Karolinska en Estocolmo y autor principal de la preimpresión. Para estudiar la afección, el equipo recopiló datos de 24 estudios en los que participaron un total de casi 6500 personas diagnosticadas con COVID prolongado, así como más de un millón de otros participantes que sirvieron como controles.
En un análisis que combinó datos de 11 de esos estudios, los investigadores encontraron una región particular del genoma que se asoció con aproximadamente 1,6 veces más probabilidades de desarrollar COVID prolongado. Ese segmento de ADN está cerca de un gen llamado FOXP4 , que está activo en los pulmones y otros órganos. La variante vinculada a la COVID prolongada también se asocia con una mayor expresión de FOXP4 en las células pulmonares.
Investigaciones anteriores han relacionado el mismo gen con un mayor riesgo de COVID-19 grave, y Zeberg y sus colegas encontraron que también está asociado con el cáncer de pulmón. Aunque tener una COVID-19 grave aumenta el riesgo de desarrollar una COVID-19 prolongada, el equipo descubrió que la contribución de la variante de ADN al riesgo de una COVID-19 prolongada era demasiado grande para explicarse solo por su vínculo con la COVID-19 grave. “Esta variante tiene un impacto mucho más fuerte en el COVID prolongado que su impacto en la gravedad”, dice Zeberg.
Reproducir ese hallazgo en otros conjuntos de datos ayudaría a fortalecer las conclusiones del estudio, dice Zhongshan Cheng, bioinformático del St. Jude Children's Research Hospital en Memphis, Tennessee. Gran parte de los datos utilizados en el análisis de COVID-19 prolongado también se utilizaron en el análisis que encontró un vínculo entre FOX4P y el COVID-19 grave, señala. Los datos recientes ayudarían a descartar la posibilidad de que otros factores, como el cáncer de pulmón, pudieran haber influido en la aparente asociación con FOX4P .
Más por venir
Aun así, el estudio es un gran avance, dice Cheng, y los estudios futuros probablemente se sumarán a la lista de factores de riesgo genéticos para un COVID prolongado.
“No será solo una respuesta única, habrá una gran variedad de vulnerabilidades de las personas que contribuirán a por qué no se han recuperado de COVID”, dice Ponting. Él y sus colegas propusieron un estudio que habría incluido ADN de 15.000 personas con COVID prolongado. Pero los revisores de subvenciones rechazaron la propuesta, dice, porque pensaron que la condición era demasiado compleja para ser diseccionada en la forma sugerida por el equipo de Ponting.
“No estoy de acuerdo”, dice. “Es muy complicado, pero también muy importante desmontar. Los costos sanitarios y socioeconómicos de un COVID prolongado son enormes”.
El estudio, que se publicó como preimpresión el 1 de julio , utilizó datos recopilados de 6450 personas con COVID prolongado en 16 países. Los investigadores esperan que este análisis sea solo el comienzo: se requiere una gran cantidad de datos para descubrir un trastorno tan complejo como el COVID, que se ha asociado con más de 200 síntomas, que incluyen fatiga severa, dolor nervioso y dificultades con la concentración y la memoria. .
“Es muy importante que se realice este tipo de estudio”, dice Chris Ponting, quien estudia bioinformática médica en la Universidad de Edimburgo, Reino Unido. “Ganará impulso y mayor poder a medida que aumente el número de casos”.
Dichos estudios son los primeros pasos para aprender más sobre las causas de la COVID prolongada, dice Stéphanie Longet, inmunóloga de la Universidad Jean Monnet en Saint-Étienne, Francia, que tiene COVID prolongada. “Hay varios temas clave que son esenciales para los pacientes, incluidos los tratamientos y la prevención”, dice. “Cuando las causas, tal vez multifactoriales, [se] entiendan claramente, ayudará a tratar a los pacientes que serán más susceptibles a desarrollar una COVID prolongada y potencialmente a prevenir una COVID prolongada”.
genes de susceptibilidad
Durante más de tres años, la Iniciativa de Genética del Huésped COVID-19 global ha estado buscando secuencias de ADN que estén asociadas con un riesgo de desarrollar COVID-19 grave. Esa caza, que está en curso, ha implicado genes involucrados en el sistema inmunológico y en permitir que el virus SARS-CoV-2 ingrese a las células 2 .
El largo estudio COVID es un derivado de ese esfuerzo, dice Hugo Zeberg, genetista del Instituto Karolinska en Estocolmo y autor principal de la preimpresión. Para estudiar la afección, el equipo recopiló datos de 24 estudios en los que participaron un total de casi 6500 personas diagnosticadas con COVID prolongado, así como más de un millón de otros participantes que sirvieron como controles.
En un análisis que combinó datos de 11 de esos estudios, los investigadores encontraron una región particular del genoma que se asoció con aproximadamente 1,6 veces más probabilidades de desarrollar COVID prolongado. Ese segmento de ADN está cerca de un gen llamado FOXP4 , que está activo en los pulmones y otros órganos. La variante vinculada a la COVID prolongada también se asocia con una mayor expresión de FOXP4 en las células pulmonares.
Investigaciones anteriores han relacionado el mismo gen con un mayor riesgo de COVID-19 grave, y Zeberg y sus colegas encontraron que también está asociado con el cáncer de pulmón. Aunque tener una COVID-19 grave aumenta el riesgo de desarrollar una COVID-19 prolongada, el equipo descubrió que la contribución de la variante de ADN al riesgo de una COVID-19 prolongada era demasiado grande para explicarse solo por su vínculo con la COVID-19 grave. “Esta variante tiene un impacto mucho más fuerte en el COVID prolongado que su impacto en la gravedad”, dice Zeberg.
Reproducir ese hallazgo en otros conjuntos de datos ayudaría a fortalecer las conclusiones del estudio, dice Zhongshan Cheng, bioinformático del St. Jude Children's Research Hospital en Memphis, Tennessee. Gran parte de los datos utilizados en el análisis de COVID-19 prolongado también se utilizaron en el análisis que encontró un vínculo entre FOX4P y el COVID-19 grave, señala. Los datos recientes ayudarían a descartar la posibilidad de que otros factores, como el cáncer de pulmón, pudieran haber influido en la aparente asociación con FOX4P .
Más por venir
Aun así, el estudio es un gran avance, dice Cheng, y los estudios futuros probablemente se sumarán a la lista de factores de riesgo genéticos para un COVID prolongado.
“No será solo una respuesta única, habrá una gran variedad de vulnerabilidades de las personas que contribuirán a por qué no se han recuperado de COVID”, dice Ponting. Él y sus colegas propusieron un estudio que habría incluido ADN de 15.000 personas con COVID prolongado. Pero los revisores de subvenciones rechazaron la propuesta, dice, porque pensaron que la condición era demasiado compleja para ser diseccionada en la forma sugerida por el equipo de Ponting.
“No estoy de acuerdo”, dice. “Es muy complicado, pero también muy importante desmontar. Los costos sanitarios y socioeconómicos de un COVID prolongado son enormes”.
Con información de
Nature
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